Dans le menu Actions, la commande Supprimer supprime les fichiers et dossiers sélectionnés d'un ou des deux côtés de la comparaison.
Si un dossier est sélectionné, son contenu entier sera supprimé sans tenir compte des filtres de fichiers ou des filtres d'affichage actuels. Si un dossier ouvert est sélectionné et également ses enfants, alors la sélection du dossier est ignorée et c'est uniquement ses enfants sélectionnés qui seront supprimés.
Autoriser l'option Utiliser la corbeille si possible pour déplacer les fichiers et dossiers stockés sur un disque local vers la Corbeille au lieu de les détruire complètement. Cette option est ignorée pour les suppressions sur des disques réseau, pour les sites FTP et à l'intérieur des fichiers zip.